NEBNextDirect 客户定制 Panels–NEB酶试剂

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/靶向富集

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特性

提供从单个基因到几百个基因的不同选择

无与伦比的特异性和均一覆盖度
快速:省去合成和优化的步骤
使用唯一分子标签(UMI)进一步提高灵敏度
用户友好的自动化工作流程,在一天内即可得到结果
 

概述

 NEBNext Direct 客户定制 Panels 采用独特的 NEBNext Direct 杂交富集技术,可为用户快速定制目标靶向基因,并可直接用于Illumina 测序平台。所提供的基因列表经精心设计优化,其探针将完整覆盖所有编码(外显子)区域。您可任意设计组合目标基因,生成的高品质 Panels 都将迅速交付。

NEBNext Direct 客户定制 Panels 可提供的基因持续更新,目前包括与多种转化研究领域相关的基因,如癌症、神经疾病、心脏病、自闭症、严重免疫缺陷、囊性纤维化和美国医学遗传学院所推荐的基因。

NEBNext Direct 客户定制 Panels 可包括低至单个特定基因,高至总量为 1.5 Mb 的目标基因,并对组合基因没有限制。每个Panels 在运输前都已完成测试,测序结果通过用户结果报告交付。

Panels 中每个基因的捕获探针设计都经过严格的开发和优化过程,以此最大程度地提高特异性和捕获均一性。

NEBNextDirect 客户定制 Panels--NEB酶试剂

不同大小的 NEBNext Direct 客户定制 Panels 都展现了绝佳性能。关键目标的富集度可评估靶向富集在不同大小 Panels 中的一致性表现。使用100ng DNA,分别对 1、10、25、50 和100 个基因进行靶向富集,并通过 Illumina 平台测序,采用双端150 bp 的测序策略。较大的 Panels 包含小 Panels 的所有基因。

NEBNextDirect 客户定制 Panels--NEB酶试剂

比较不同大小的 Panels 和不同 DNA 起始量之间的突变体检测灵敏度。将 24 HapMap 样本混合,得到等位基因突变体百分数(VAF)低于 2% 的起始样本。将 2550100200 500 ng混合DNA 作为起始样本,分别选用含 1102550 100 个基因的 NEBNext Direct 客户定制 Panels 进行检测。较大的 Panels 包含小 Panels 的所有基因。文库通过 Illumina 平台 2 x 150 bp 进行测序,并使用 MutectVardict算法得到突变体。

NEBNextDirect 客户定制 Panels--NEB酶试剂

不同大小的 NEBNext Direct 客户定制 Panels 都能保证目标捕获的准确性。IGV 图显示了包含 1102550 100 个基因的Panels 中,4 BRAF 外显子的分布情况,证明了捕获靶基因的一致性。上述 5 Panels 都是 100 ng DNA 的起始量,其中包含 BRAF 基因。文库通过 Illumina 平台 2 x 150 bp 进行测序。