NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNA)–NEB酶试剂

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/接头 & 引物

NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNA)                              收藏

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#E7416L
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相关产品:

 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)

产品特点:

 

·  高效稳定的连接效率

·  可支持更高通量

· 专为 RNA 文库优化

·  更准确地测定转录本丰度

概述:

 用于 Illumina® 平台的 NEBNext® 多样本接头引物是 NEBNext® 文库制备系列产品的重要组成部分,有多种不同的产品可用于 NEBNext® 产品或其它标准的 Illumina® 平台兼容的文库制备流程。该产品(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNANEB #7416)为 RNA 测序流程设计和优化。这些独特的双端检索引物接头还分别包含一段唯一的分子标签序列(UMI),包含一个独特的分子条形码(UMI)序列,以便更准确地分析转录组。通用引物也包含在内。

可提供适用于 DNA 测序的 NEBNext® Unique 双端 UMI 接头(NEB #E7395),也可提供单端、双端和 Unique 双端引物以及优化的接头。

产品描述:

 NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNA)--NEB酶试剂

NEBNext® Unique 双端 UMI 接头具有同样有效的连接和随后扩增。

A:以通用人参考 RNAAgilent 740000)为起始样本,使用 NEBNext® Poly(A) mRNA 磁性分离模块(NEB #E7490)富集后,使用 NEBNext® Ultra II RNA 定向文库制备试剂盒(NEB #E7760)制备 96个文库。使用 Agilent Tapestation 4200 评估建库产量,通过将单个文库产量除以 96 个所有文库的平均产量对文库进行标准化。所有 96 Unique 双端 UMI 接头的一致性和连接效率都很高。每个条形图代表至少 2 个技术重复的平均值。

BNEBNext® Unique 双端 UMI 接头具有均一的聚类效率。文库使用 Illumina NextSeq® 500PE70)测序。每个文库预计占测序 reads 总数的1.04%通过将实际的 reads 数除以预期的 reads 数对文库产量进行标准化。96 Unique 双端 UMI 接头均未出现偏差

 

NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNA)--NEB酶试剂

相较于其它 UMI 接头竞品,NEBNext Unique 双端 UMI 接头性能更优越。

以通用人参考 RNA 为起始样本,使用 NEBNext® Poly(A) mRNA 磁性分离模块(NEB #E7490)富集后,使用 NEBNext® Ultra II RNA 定向文库制备试剂盒(NEB #E7760)制备文库。

 

A:以 10 ng100 ng 1,000 ng 的总 RNA 为起始样本,图中显示了三个重复的平均文库产量。使用 NEBNext® Unique 双端 UMI 接头或 IDT xGen 双端接头进行接头连接。使用 Agilent Tapestation 4200 评估最终建库产量
B
:文库使用 Illumina NextSeq® 500PE70)测序。Reads 降采样(seqtk500 万,并使用 HISAT 2.1 比对至 GRCh38 参考基因组。使用 fgbioAnnotateBamWithUmis)添加 UMI 信息,并使用 MarkDuplicatesPicard 2.18.2.1)标记含有 UMI reads 和检测重复率。NEBNext® Unique 双端 UMI 接头产生的文库产生的重复更少。

实验流程:

 NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNA)--NEB酶试剂