土壤DNA提取试剂盒 ISOIL for Beads Beating

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土壤DNA提取试剂盒土壤DNA提取试剂盒                              ISOIL for Beads Beating

ISOIL for Beads Beating

 


原理

  本品为土壤 DNA 提取试剂盒。利用珠状物的强物理性粉碎及试剂的溶菌作用,从具有坚固细胞壁的微生物中提取DNA。因此,可用于 PCR-DGGE 等分析上土壤微生物的群集构造,利用定量土壤 DNA 推算土壤生物量。

  土壤等环境中存在各种各样的微生物。但其中 99% 以上为不能培养,或极难培养的微生物。依赖培养法分析土壤微生物具有一定的局限性。因此,像这类坏境样品一般采用不经培养,直接提取 DNA 进行分析的手法。近几年普遍盛行:利用土壤和污泥等环境样品直接提取出的 DNA,进行基因复制及 PCR-DGGE 等分析微生物群集构造。

  海外制造商正在销售的集中土壤 DNA 提取试剂盒,都较难从黑土(占日本的国土的20%,耕地的50%)等火山灰土壤中提取 DNA,无法与日本的土壤相融合。本试剂盒适用于提取日本土壤 DNA,可短时间、高产率提取出高纯度 DNA。

 

       本品采用在界面活性剂存在下加热提取的方法作为 DNA 提取法。利用 Beads Beating(珠状粉碎),采用物理性菌体粉碎重组法。利用 Beads Beating 物理性截断,可从具有坚固细胞壁的微生物中,提取出反映实际土壤微生群集构造的土壤 DNA。因此,本品提取出的土壤 DNA,可用于 PCR-DGGE 等分析土壤微生物的群集构造和进行土壤诊断,利用定量土壤 DNA 推算土壤生物量等。DNA 提取时间大约需要60分钟。

       另外,使用本品时,请不要使用其他用途的 Beads Beating(珠状粉碎机)。

 

 

特征

 ● 可从火山灰土壤中提取 DNA

 ● 可有效提取高纯度 DNA

 ● 最短40分钟,即可提取出 DNA

 ● 容易按比例增加

 ● 可高效提取 DNA

 ● 适用于 PCR-DGGE 法及土壤 DNA 定量

 

 

内容

● ISOL

 

Lysis Solution HE

50 mL×1

Lysis Solution   20S

1.25 mL×2

Purification Solution

20 mL×1

Precipitation Solution

40 mL×1

Wash Solution

50 mL×1

Ethachinmate

100 µL×1

TE(pH8.0)

5 mL×1

poly-roto

1个

手册

1本

保存条件

室温

产品编号 产品名称 产品规格 产品等级
319-06201 ISOIL for Beads Beating
土壤DNA提取试剂盒
50次

土壤DNA提取试剂盒 ISOIL for Beads Beating

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土壤DNA提取试剂盒土壤DNA提取试剂盒                              ISOIL for Beads Beating

ISOIL For Beads Beating/ISOIL Large for Beads ver.2



◆原理

       ISOIL For Beads Beating 是能够萃取土壤中 DNA 的试剂盒,使用界面活性剂能够进行化学性的溶菌和 Beads Beating 的物理性菌体破碎从而萃取出土壤中的 DNA 。即使有坚固细胞壁的微生物中也能萃取出 DNA,根据萃取出的 DNA 可以知道土壤微生物的集群结构。所以使用本试剂盒萃取出的土壤 DNA 能够使用 PCR-DGGE 解析出土壤微生物的集群结构以及土壤诊断、土壤 DNA 的定量,从而知道土壤中生物的数量。

       ISOIL Large For Beads VER2 是能够从5g 土壤样本中萃取出 DNA 的试剂盒。将界面活性剂进行的化学性溶菌和 Beads 进行的物理性菌体破碎 共同使用,能够高效地萃取出土壤中的 DNA。除了萃取的基本步骤,还有再提纯的另外两种步骤可选,使用范围更广。

产品编号 产品名称 产品规格 产品等级
319-06201 ISOIL for Beads Beating
DNA提取试剂
50次用
312-06791 ISOIL Large for Beads ver.2
DNA提取试剂
8次用

ISOIL for RNA 从土壤提取RNA试剂盒

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从土壤提取RNA试剂盒ISOIL for RNA                              从土壤提取RNA试剂盒

ISOIL for RNA

ISOIL for RNA                              从土壤提取RNA试剂盒

  ISOIL for RNA适用于从土壤样品提取RNA。可利用磁珠对细胞壁较厚的微生物进行强力的破坏,并利用试剂进行溶菌裂解,从而提取其RNA。RNA提取液添加氟化物,可从非火山灰土壤及火山灰土壤提取RNA。进行纯化时,采取有效去除阻碍酶反应的腐殖质等杂质,可简单地纯化出高纯度RNA。提取到的土壤RNA可用于RT PCR-DGGE分析及RT real-time PCR。

  本产品十分适合从日本土壤提取RNA,仅需约4小时即可提取大量的高纯度RNA。

  使用时,需配合磁珠式破碎装置(适用2 mL试管)使用。

◆特点

  • 适用于火山灰土壌(火山灰土等)

  • 有效提取高纯度RNA

  • 操作用时仅需约4小时

◆产品内容

ISOIL for RNA (50次用量)

产品

包装

保存

备注

Beads Tube R (ISOIL for RNA)

50 瓶

室温

2 mL容量的试管中含有磁珠。

Sodium Silicofluoride Solution

10 mL × 1

室温

非医疗用剧毒物
氟硅酸钠溶液

Lysis Solution R

1.25 mL × 3

室温

Lysis Solution 20S

25 mL × 1

室温

Lysis Solution 20S有可能析出白色结晶,不影响其品质及性能。如发生此情况,请65°C条件下,对整个容器进行孵化(适当混合),待结晶完全溶解后使用。

Purification Solution R

25 mL × 1

室温

Purification Solution R有可能析出白色结晶不影响其品质及性能。如发生此情况,请65°C条件下,对整个容器进行孵化(适当混合),待结晶完全溶解后使用。

Precipitation Solution R

35 mL × 1

室温(冷藏)

开封后需冷藏(2~10°C)。Precipitation Solution R较容易发霉,如发现溶液中有浮游物,请停止使用,并购买新的试剂盒。

Ethachinmate

100 μL × 1

室温(冷藏)

开封后需冷藏(2~10°C)。

3M Sodium Acetate(pH5.2)

500 μL × 1

室温

TE(pH8.0)

10 mL × 1

室温

Deoxyribonuclease(RT Grade)

250 units × 1

-20°C

10× DNaseRT GradeBuffer

1 mL × 1

-20°C

2 mg/mL BSA Solution

1 mL × 1

-20°C

◆使用例子

操作流程

ISOIL for RNA                              从土壤提取RNA试剂盒

  

▶ *1)*17) 注释请参照产品手册。


操作实例  从英石火山灰土壤提取RNA(电泳结果及RT-PCR)

  从8种土壤样品提取RNA。 分别使用ISOIL for RNA从0.5 g、0.25 g的含有英石的火山灰土壤中提取RNA ,配制成溶液(10 μL)后,4.7 μL用于电泳取样后,0.5 g的土壤样品为冷藏(4℃)一周,0.25 g的土壤样品为冷藏(4℃)三周。

ISOIL for RNA                              从土壤提取RNA试剂盒


从0.5 g的样品提取RNA溶液

  ▶ 一般情况下,可以从土壤中提取RNA,但有些土壤种类难以提取。


ISOIL for RNA                              从土壤提取RNA试剂盒


从0.25 g的样品提取RNA溶液

  ▶ 对于难以从0.5 g样品提取RNA的土壤,减少样品品量,即可回收更多的RNA。

  将实验中的0.5 g土壤样品RNA溶液作为模板,使用RT-PCR扩增16S rRNA(约 200 base)将获得的PCR产物进行电泳。

ISOIL for RNA                              从土壤提取RNA试剂盒

              

RNA 溶液的RT-PCR

  

Lane 1 东大弥生农场对照区土壌 (英石火山灰土壤、火山灰土壌)

Lane 2 东大牧场 牧草地 (英石火山灰土壤、火山灰土壌)
Lane 3 筑波 农业环境技术研究所 (英石火山灰土壤、火山灰土壌)
Lane 4 东大田无牧草地 (英石火山灰土壤、火山灰土壌)
Lane 5 草地试验场常年採草地土壌 (灰色低地土、含有一部分火山灰土壌)
Lane 6 千叶农试森林土壌 (英石火山灰土壤、火山灰土壌)
Lane 7 兵库农试森林土壌 (褐色森林土、非火山灰土壌)
Lane 8 富山县 射水市 片口田土壌 (非火山灰土壌)
M RNA Ladder
M11 Marker 11(pUC19/Msp I digest)


  ▶ 即使是难以从0.5 g样品提取RNA的土壤,也可从RNA 溶液获得RT-PCR产物。



◆备注

  • 本产品是实验研究试剂。请勿用于医疗及其他用途。

  • 如果您对试剂的基本的知识不了解,请不要使用。

  • Sodium Silicofluoride Solution(氟硅酸钠溶液)为非医疗用剧毒物(苯酚制剂),请小心操作

  • 使用时请穿着适当的防护设备(手套、眼镜等)。

  • 请按照说明书进行操作。

  • 对于因不按照说明书操作而导致的事故,Nippon Gene不负任何责任。

License

  Nippon Gene 公司正向独立行政法人科学技术振兴机构(JST)申请ISOIL for RNA土壌RNA提取法的专利。土壌RNA的提取法及纯化法已获得JST的认可。


◆资料 Data Sheet

  产品手册

  ·         ISOIL for RNA 第一版 PDF 192 KB

  SDS(Safety Data Sheet)

  ·         ISOIL for RNA (PDF)

◆相关产品

  ·         土壌提取DNA试剂盒 ISOIL

  ·         土壌提取DNA试剂盒 ISOIL for Beads Beating

  ·         土壌(5g)提取DNA试剂盒 ISOIL Large for Beads ver.2



Q:  按照操作流程进行了DNase 处理,RNA 溶液里有DNA残留。

A:  某些土壤样品难以去除杂质(尤其是英石火山灰土壤),阻碍DNase处理等酶反应。建议使用RNA 提取纯化试剂盒 ISOGEN II

产品编号 产品名称 产品规格 产品等级
312-07411 ISOIL for RNA 50次用量