PacBio Sequel IIe单分子实时测序系统 PacBio Sequel IIe System

PacBio Sequel IIe单分子实时测序系统

PacBio Sequel IIe System

详细描述:

PacBio Sequel IIe 采用单分子实时(Single Molecule,Real-Time,SMRT®)测序技术。通过从数百万个零模波导孔中,对原始的长片段DNA进行天然的DNA复制,收集相应的数据差从而完成测序的过程。

SMRT测序的原理

PacBio Sequel IIe单分子实时测序系统 PacBio Sequel IIe System

SMRT测序的优势

PacBio Sequel IIe单分子实时测序系统 PacBio Sequel IIe System

什么是HiFi Reads?

采用环形一致性测序 (Circular Consensus Sequencing,CCS) 技术生成的 HiFi reads,包含丰富的数据,帮助您解释诸多复杂的生物学问题。

PacBio Sequel IIe单分子实时测序系统 PacBio Sequel IIe System

有了 PacBio® HiFi reads,您不再需要在长读长测序和高精度测序之间折衷。

PacBio Sequel IIe单分子实时测序系统 PacBio Sequel IIe System


HiFi Reads的优势

√ 读长可长达 25 kb

√下机数据准确率 >99.9%

√ 简单的建库流程

√ 低金畔生物组覆盖度要求

√ 数据文件精简,最大程度缩短计算时间

√ 仅使用一个技术解决方案即可满足多种应用需求

√ 出色的数据清晰度,可进行快速解析

PacBio Sequel IIe单分子实时测序系统 PacBio Sequel IIe System

PacBio Sequel IIe单分子实时测序系统 PacBio Sequel IIe System


SMRT测序的应用

PacBio Sequel IIe单分子实时测序系统 PacBio Sequel IIe System

大小:W 92.7m×D 91.4cm×H 167.6cm

重量:362kg

环境温度:19ºC – 25ºC ± 2°C per hour

湿度:20% – 80%, 非冷凝

单张芯片上ZMW小孔数量:800万个

具有以下性能:

  1. 无于伦比的高准确度长读长测序

    PacBio提供高度准确的长读长的测序技术(HiFi Reads),在读长达到15-20 kb的情况下,可提供Sanger测序相当的准确度(> 99%),满足组装复杂金畔生物组的需要,可检测从单核苷酸突变到结构变异的各种金畔生物组变异。

    PacBio使用环形一致性测序(CCS)模式产生HiFi Reads,以提供具有> 99.9%单分子读取准确度的碱基水平分辨率。

  2. 单分子实时检测

    无需PCR扩增,避免PCR引入的系统误差及对扩增片段的偏好性引起的信息缺失。

    每一条模板链都可获得相应序列信息,数据覆盖均匀、准确;

    还可以检测包括稀有变异在内的各种突变型,反映各种突变型的频率。

  3. 覆盖深度几乎不受序列中GC含量差异的影响

    可测定高GC含量的区域,高度重复片段区域,100% A+T序列等基于模板PCR的测序技术难以逾越的区段。

  4. 可同时获得聚合酶反应动力学信息,进行甲基化等修饰碱基的直接测定,还可区分不同基团的甲基化修饰及其它碱基修饰。

PacBio Sequel IIe单分子实时测序系统 PacBio Sequel IIe System
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PacBio Revio单分子实时测序系统 PacBio Revio System

PacBio Revio单分子实时测序系统

PacBio Revio System

详细描述:

Revio测序系统带来更低成本和更高通量的HiFi测序,同时保持卓越的准确性和可实现甲基化直接检测。

PacBio Revio单分子实时测序系统 PacBio Revio SystemHiFi reads 通量增加 15 倍*

Revio 系统采用高密度且每张拥有 2,500 万个ZMW 的 SMRT® Cell 芯片,并行运行最多 4 张SMRT Cell 芯片,24 小时运行时间,每天可获得 360 Gb 的 HiFi reads,相当于每年能对1,300 个人类全金畔生物组进行测序。

PacBio Revio单分子实时测序系统 PacBio Revio System使用过程更简单,减少了不必要的耗材

Revio 系统操作简单,得益于整合了的试剂与样本板,快速运行设置,测序进行过程中能对运行进行灵活排序,以及无需外部氮供应。

PacBio Revio单分子实时测序系统 PacBio Revio SystemGoogle DeepConsensus 等更多机载算法

Revio 系统上的高级算法可以实现非常高的读取准确率,并在每次运行时实现甲基化检出。优化的文件格式通过质量值结合与智能 read 排序减少了数据存储需求。

PacBio Revio单分子实时测序系统 PacBio Revio System价值 1,000 美元的完整定相 HiFi 金畔生物组

HiFi 测序能通过单次文库与测序运行,提供小的变异、结构变异、重复扩增、甲基化与单倍型定相情况。


*与Sequel II/Sequel IIe 相比

大小:92.7 cm × 90.2 cm × 174.5 cm

重量:449 kg 

环境温度:19–25°C

湿度:20–80% 相对湿度, 非冷凝

单张芯片上ZMW小孔数量:2500万个

通量:1-4个cell

文库大小:15-18kb

HiFi数据产出:90G/cell,360G/run

碱基质量:90%>Q30

测序运行时间:24小时

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